Desenvolvimento e avaliação de ferramenta para detecção de vírus das famílias Rhabdoviridae e Kitaviridae
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Data
2023-12
Tipo de documento
Artigo Científico
Título da Revista
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Área do conhecimento
Modalidade de acesso
Acesso fechado
Editora
Autores
GONZALEZ, Gianluca de Lima Michea
SANTOS, Giovana Silva dos
LAURINDO , Nicolly de Sousa Silva
Orientador
GONZALEZ, Pedro Luis Ramos
Coorientador
MALONE, Camila Francieli da Silva
Resumo
O Brasil é um dos grandes produtores agrícolas do mundo. O país possui condições climáticas favoráveis para o desenvolvimento de uma variedade de culturas como citros, café e maracujá, que geram grandes lucros econômicos, e são notáveis fontes de renda e emprego. O fator climático também traz consigo desafios, especialmente porque facilita o desenvolvimento de fitopatógenos que podem causar doenças graves nas plantações. As famílias Rhabdoviridae e Kitaviridae compreendem uma ampla diversidade de espécies de vírus que hospedam essas e outras culturas comerciais. A detecção eficaz desses patógenos torna-se essencial para o manejo apropriado das doenças que eles causam. Dentre as técnicas moleculares, a reação em cadeia da polimerase (PCR) é uma das mais utilizadas na detecção de patógenos virais. A especificidade e sensibilidade da técnica depende de iniciadores empregados. Os iniciadores são pequenos fragmentos de DNA de fita simples com aproximadamente 19 a 22 nucleotídeos, que definem a região alvo a amplificar. A partir disso, o objetivo deste estudo foi desenhar e validar iniciadores específicos para a detecção de kitavírus e rhabdovírus recém-descobertos e avaliar iniciadores degenerados ainda não publicados. Foram analisadas amostras de folhas e frutos coletados em diferentes regiões da América do Sul entre 2019 e 2023. A extração de RNA e síntese de cDNA foram realizadas. O produto de PCR foi purificado, clonado e sequenciado. Os iniciadores específicos desenhados demonstraram ser efetivos para as amostras testadas, validando sua utilidade na detecção dos vírus alvos. No entanto, os iniciadores degenerados enviados apresentaram resultados menos satisfatórios.
Palavras-chave
Reação em cadeia da polimerase, iniciadores, técnicas de diagnostico moleculares